Protein–RNA interactions for Protein: P56704

WNT3A, Protein Wnt-3a, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WNT3AP56704 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
WNT3AP56704 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms