Protein–RNA interactions for Protein: P54762

EPHB1, Ephrin type-B receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB1P54762 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EPHB1P54762 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 189.4 ms