Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 PROZ-201ENST00000342783 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 OR2W3-201ENST00000360358 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 S100A2-202ENST00000368708 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 MRPL55-219ENST00000391867 685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 SUMO1-206ENST00000409368 1187 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 AC007679.1-201ENST00000458609 502 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 AP003043.1-201ENST00000527804 547 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 ABCC6P1-203ENST00000565566 1170 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 ZNF850-201ENST00000589390 523 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 NRG1-211ENST00000520502 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 HAX1-201ENST00000328703 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 RBP4-203ENST00000371469 814 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 HNF1A-AS1-201ENST00000433033 612 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 AL356000.1-201ENST00000441073 1238 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 CIDEC-205ENST00000443115 443 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 AC026412.1-206ENST00000502273 206 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 NDUFB2P1-201ENST00000506966 295 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 PHBP18-201ENST00000546648 813 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 RN7SL480P-201ENST00000581481 294 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 IFNL3P1-201ENST00000595082 501 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 AL513478.2-202ENST00000621949 835 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 LINC02498-201ENST00000635390 1065 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 TP63-206ENST00000392463 1386 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 KCNMA1-AS1-201ENST00000426234 863 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 AP003168.2-201ENST00000531215 471 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 GSTT2-203ENST00000634759 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 TAGLN3-205ENST00000478951 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 PSMC5-212ENST00000581882 1474 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 TUBAL3-201ENST00000380419 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 S100B-201ENST00000291700 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 OR52V1P-201ENST00000515557 898 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 BLOC1S1-203ENST00000548925 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 CYB5D2-202ENST00000573984 495 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 EMP3-204ENST00000596315 761 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 LINC01588-216ENST00000623502 975 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 PDE4DIP-202ENST00000369347 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 SAA1-202ENST00000405158 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 RN7SKP212-201ENST00000410851 328 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 TGFBI-207ENST00000508076 1034 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 ISL1-203ENST00000511384 981 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 RNA5SP288-201ENST00000516075 93 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 AC087072.1-201ENST00000603727 421 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms