Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 NR1I3-201ENST00000367979 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 NR1I3-207ENST00000367985 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 SH3BGR-202ENST00000380631 780 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 RPL18AP15-201ENST00000430258 517 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 AC007391.1-201ENST00000433893 504 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 AC005009.2-201ENST00000452471 687 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 NR1I3-225ENST00000508387 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 AC122694.1-201ENST00000510987 563 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 AC254633.1-201ENST00000606790 345 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 KRT37-201ENST00000225550 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 NRG1-211ENST00000520502 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 ZNF570-202ENST00000586475 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 IZUMO1R-201ENST00000328458 798 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 MKNK1-205ENST00000428112 1270 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 PHBP18-201ENST00000546648 813 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 AL157871.1-201ENST00000555428 429 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 ZNF850-201ENST00000589390 523 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 IFNL3P1-201ENST00000595082 501 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 DPPA5-201ENST00000370370 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 DMKN-211ENST00000436012 848 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 AC024405.2-201ENST00000528459 810 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 MYL6-215ENST00000549566 685 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 ECSIT-211ENST00000592312 1286 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 LINC00969-241ENST00000600527 852 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 SNX20-205ENST00000610485 557 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 LINC00969-322ENST00000630170 584 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 ERAS-202ENST00000636362 826 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 TP63-206ENST00000392463 1386 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 HSD3BP1-201ENST00000286193 1111 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 RPLP1-202ENST00000357790 445 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 CASP2-203ENST00000392925 616 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 MRPS12-202ENST00000402029 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 ASS1P1-201ENST00000402854 1237 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 FTH1P18-201ENST00000412071 549 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 AL359182.1-201ENST00000435915 469 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 AL445363.2-201ENST00000554608 837 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 AL031710.1-201ENST00000570022 468 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 AC007292.1-201ENST00000594444 746 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 HCG18-241ENST00000602290 821 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 AL445363.1-201ENST00000623749 952 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 RAPGEFL1-202ENST00000456989 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 BPIFB6-201ENST00000349552 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 HORMAD1-202ENST00000361824 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 ZNF143-202ENST00000396597 1954 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SMARCA2P51531 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 CA2-201ENST00000285379 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 JPT2-203ENST00000382711 894 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 POLR2LP1-206ENST00000444785 187 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 KCNC4-AS1-201ENST00000455967 748 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 AC090907.2-201ENST00000559857 720 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 EMP3-204ENST00000596315 761 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 PACRG-AS3-203ENST00000614038 1246 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 CRABP2-204ENST00000621784 1033 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms