Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR1P43307 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR1P43307 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR1P43307 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR1P43307 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR1P43307 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR1P43307 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR1P43307 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR1P43307 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR1P43307 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR1P43307 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR1P43307 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR1P43307 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR1P43307 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR1P43307 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR1P43307 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR1P43307 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR1P43307 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR1P43307 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR1P43307 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR1P43307 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR1P43307 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR1P43307 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR1P43307 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSR1P43307 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR1P43307 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR1P43307 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR1P43307 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR1P43307 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR1P43307 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR1P43307 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR1P43307 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR1P43307 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR1P43307 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR1P43307 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR1P43307 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR1P43307 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR1P43307 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR1P43307 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR1P43307 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR1P43307 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR1P43307 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR1P43307 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR1P43307 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR1P43307 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR1P43307 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR1P43307 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR1P43307 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR1P43307 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR1P43307 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR1P43307 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR1P43307 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR1P43307 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR1P43307 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR1P43307 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR1P43307 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR1P43307 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR1P43307 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR1P43307 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR1P43307 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR1P43307 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR1P43307 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR1P43307 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR1P43307 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR1P43307 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR1P43307 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR1P43307 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR1P43307 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR1P43307 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR1P43307 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR1P43307 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR1P43307 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR1P43307 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSR1P43307 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSR1P43307 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSR1P43307 CACNA1G-232ENST00000515411 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSR1P43307 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSR1P43307 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSR1P43307 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSR1P43307 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSR1P43307 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSR1P43307 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSR1P43307 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSR1P43307 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSR1P43307 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSR1P43307 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSR1P43307 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSR1P43307 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSR1P43307 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSR1P43307 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSR1P43307 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSR1P43307 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSR1P43307 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSR1P43307 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSR1P43307 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SSR1P43307 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SSR1P43307 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SSR1P43307 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSR1P43307 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SSR1P43307 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms