Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP8P40818 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP8P40818 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP8P40818 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP8P40818 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP8P40818 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP8P40818 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP8P40818 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP8P40818 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP8P40818 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP8P40818 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP8P40818 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP8P40818 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP8P40818 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP8P40818 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP8P40818 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP8P40818 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP8P40818 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
USP8P40818 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP8P40818 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP8P40818 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
USP8P40818 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP8P40818 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP8P40818 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP8P40818 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP8P40818 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP8P40818 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP8P40818 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP8P40818 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP8P40818 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
USP8P40818 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
USP8P40818 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP8P40818 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP8P40818 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
USP8P40818 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP8P40818 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP8P40818 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP8P40818 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP8P40818 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP8P40818 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP8P40818 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP8P40818 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP8P40818 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
USP8P40818 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP8P40818 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP8P40818 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP8P40818 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP8P40818 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP8P40818 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP8P40818 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP8P40818 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP8P40818 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP8P40818 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP8P40818 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP8P40818 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP8P40818 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP8P40818 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP8P40818 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP8P40818 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP8P40818 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
USP8P40818 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP8P40818 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP8P40818 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP8P40818 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP8P40818 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP8P40818 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP8P40818 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP8P40818 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP8P40818 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
USP8P40818 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP8P40818 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP8P40818 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
USP8P40818 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
USP8P40818 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP8P40818 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP8P40818 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP8P40818 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP8P40818 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP8P40818 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP8P40818 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP8P40818 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP8P40818 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP8P40818 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP8P40818 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP8P40818 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP8P40818 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP8P40818 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
USP8P40818 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP8P40818 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP8P40818 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP8P40818 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP8P40818 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP8P40818 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP8P40818 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP8P40818 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP8P40818 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
USP8P40818 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP8P40818 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP8P40818 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP8P40818 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms