Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGAEP38570 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms