Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPARGP37231 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPARGP37231 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPARGP37231 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPARGP37231 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPARGP37231 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPARGP37231 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPARGP37231 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPARGP37231 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPARGP37231 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PPARGP37231 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PPARGP37231 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PPARGP37231 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PPARGP37231 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PPARGP37231 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PPARGP37231 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PPARGP37231 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PPARGP37231 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PPARGP37231 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PPARGP37231 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PPARGP37231 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PPARGP37231 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PPARGP37231 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PPARGP37231 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PPARGP37231 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PPARGP37231 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PPARGP37231 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PPARGP37231 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PPARGP37231 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PPARGP37231 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PPARGP37231 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PPARGP37231 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PPARGP37231 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PPARGP37231 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PPARGP37231 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PPARGP37231 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PPARGP37231 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PPARGP37231 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PPARGP37231 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PPARGP37231 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PPARGP37231 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PPARGP37231 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PPARGP37231 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PPARGP37231 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PPARGP37231 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PPARGP37231 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PPARGP37231 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PPARGP37231 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PPARGP37231 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PPARGP37231 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PPARGP37231 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PPARGP37231 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PPARGP37231 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PPARGP37231 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PPARGP37231 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PPARGP37231 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PPARGP37231 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PPARGP37231 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PPARGP37231 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PPARGP37231 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGP37231 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGP37231 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGP37231 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGP37231 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGP37231 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGP37231 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGP37231 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGP37231 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGP37231 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGP37231 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGP37231 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGP37231 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGP37231 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGP37231 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGP37231 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGP37231 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGP37231 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGP37231 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGP37231 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGP37231 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGP37231 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGP37231 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGP37231 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGP37231 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGP37231 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGP37231 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGP37231 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGP37231 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGP37231 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGP37231 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGP37231 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGP37231 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGP37231 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGP37231 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGP37231 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGP37231 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGP37231 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGP37231 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGP37231 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGP37231 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms