Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 AL137244.1-201ENST00000422931 865 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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HOXD10P28358 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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HOXD10P28358 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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HOXD10P28358 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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HOXD10P28358 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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HOXD10P28358 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXD10P28358 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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