Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms