Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTGS1P23219 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms