Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDSP20132 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SDSP20132 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDSP20132 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDSP20132 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SDSP20132 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDSP20132 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDSP20132 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDSP20132 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDSP20132 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDSP20132 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDSP20132 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDSP20132 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDSP20132 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDSP20132 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDSP20132 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDSP20132 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDSP20132 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDSP20132 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDSP20132 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDSP20132 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDSP20132 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDSP20132 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDSP20132 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDSP20132 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDSP20132 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDSP20132 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDSP20132 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDSP20132 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDSP20132 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDSP20132 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDSP20132 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDSP20132 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDSP20132 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SDSP20132 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDSP20132 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDSP20132 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDSP20132 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDSP20132 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDSP20132 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDSP20132 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDSP20132 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDSP20132 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDSP20132 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDSP20132 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDSP20132 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDSP20132 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDSP20132 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDSP20132 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDSP20132 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDSP20132 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SDSP20132 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SDSP20132 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SDSP20132 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SDSP20132 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SDSP20132 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SDSP20132 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SDSP20132 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SDSP20132 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SDSP20132 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SDSP20132 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SDSP20132 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SDSP20132 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SDSP20132 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SDSP20132 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SDSP20132 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SDSP20132 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SDSP20132 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SDSP20132 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SDSP20132 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SDSP20132 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SDSP20132 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SDSP20132 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SDSP20132 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SDSP20132 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SDSP20132 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SDSP20132 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SDSP20132 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SDSP20132 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SDSP20132 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SDSP20132 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SDSP20132 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SDSP20132 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SDSP20132 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SDSP20132 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SDSP20132 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SDSP20132 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SDSP20132 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SDSP20132 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SDSP20132 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SDSP20132 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SDSP20132 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SDSP20132 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SDSP20132 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SDSP20132 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SDSP20132 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SDSP20132 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SDSP20132 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SDSP20132 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SDSP20132 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms