Protein–RNA interactions for Protein: P15509

CSF2RA, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2RAP15509 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF2RAP15509 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms