Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD8P13378 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
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HOXD8P13378 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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