Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms