Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP2C9P11712 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms