Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GLI4P10075 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GLI4P10075 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GLI4P10075 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GLI4P10075 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GLI4P10075 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GLI4P10075 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GLI4P10075 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GLI4P10075 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GLI4P10075 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GLI4P10075 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GLI4P10075 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GLI4P10075 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GLI4P10075 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GLI4P10075 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GLI4P10075 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GLI4P10075 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GLI4P10075 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GLI4P10075 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GLI4P10075 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GLI4P10075 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GLI4P10075 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GLI4P10075 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GLI4P10075 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GLI4P10075 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GLI4P10075 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GLI4P10075 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GLI4P10075 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
GLI4P10075 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GLI4P10075 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GLI4P10075 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GLI4P10075 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GLI4P10075 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GLI4P10075 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GLI4P10075 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GLI4P10075 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
GLI4P10075 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
GLI4P10075 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
GLI4P10075 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GLI4P10075 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GLI4P10075 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GLI4P10075 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GLI4P10075 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
GLI4P10075 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GLI4P10075 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GLI4P10075 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GLI4P10075 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GLI4P10075 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GLI4P10075 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GLI4P10075 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GLI4P10075 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GLI4P10075 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
GLI4P10075 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GLI4P10075 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GLI4P10075 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GLI4P10075 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GLI4P10075 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GLI4P10075 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GLI4P10075 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GLI4P10075 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GLI4P10075 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GLI4P10075 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GLI4P10075 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GLI4P10075 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GLI4P10075 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GLI4P10075 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GLI4P10075 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GLI4P10075 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GLI4P10075 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GLI4P10075 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GLI4P10075 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GLI4P10075 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GLI4P10075 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GLI4P10075 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GLI4P10075 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
GLI4P10075 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
GLI4P10075 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
GLI4P10075 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
GLI4P10075 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
GLI4P10075 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
GLI4P10075 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
GLI4P10075 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
GLI4P10075 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GLI4P10075 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
GLI4P10075 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
GLI4P10075 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GLI4P10075 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GLI4P10075 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
GLI4P10075 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
GLI4P10075 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GLI4P10075 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GLI4P10075 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GLI4P10075 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GLI4P10075 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
GLI4P10075 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GLI4P10075 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
GLI4P10075 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
GLI4P10075 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GLI4P10075 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GLI4P10075 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms