Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 PAX5-203ENST00000377847 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLI3P10071 AC090696.1-201ENST00000419100 418 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLI3P10071 AL162151.1-201ENST00000423922 561 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLI3P10071 UGT1A12P-201ENST00000447084 853 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GLI3P10071 PAX5-213ENST00000523145 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLI3P10071 AC007610.1-201ENST00000568130 498 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLI3P10071 AC008555.6-201ENST00000605047 458 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLI3P10071 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLI3P10071 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLI3P10071 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLI3P10071 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLI3P10071 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GLI3P10071 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GLI3P10071 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GLI3P10071 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GLI3P10071 CFAP20-201ENST00000262498 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GLI3P10071 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GLI3P10071 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GLI3P10071 MCRS1-203ENST00000546244 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GLI3P10071 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GLI3P10071 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GLI3P10071 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GLI3P10071 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GLI3P10071 WFDC3-201ENST00000243938 1000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GLI3P10071 AL513165.1-201ENST00000413915 289 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GLI3P10071 CA5BP1-205ENST00000435806 1064 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GLI3P10071 RPL38-202ENST00000439590 431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GLI3P10071 RPSAP69-201ENST00000445739 546 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GLI3P10071 IQSEC2-205ENST00000498281 673 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GLI3P10071 CCNL2P1-201ENST00000512846 969 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GLI3P10071 HMOX2-213ENST00000575120 1027 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GLI3P10071 LINC02498-201ENST00000635390 1065 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GLI3P10071 MEP1AP1-201ENST00000636082 1097 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GLI3P10071 TGM1-202ENST00000544573 1581 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GLI3P10071 AC106785.2-201ENST00000564385 1319 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GLI3P10071 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GLI3P10071 HORMAD1-202ENST00000361824 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GLI3P10071 CLP1-202ENST00000525602 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GLI3P10071 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GLI3P10071 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GLI3P10071 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GLI3P10071 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GLI3P10071 CLEC10A-206ENST00000576617 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GLI3P10071 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GLI3P10071 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GLI3P10071 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GLI3P10071 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GLI3P10071 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GLI3P10071 LINC00449-201ENST00000366259 872 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GLI3P10071 MIR181D-201ENST00000384853 137 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GLI3P10071 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GLI3P10071 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GLI3P10071 FAM157A-201ENST00000437428 1141 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GLI3P10071 ALDOAP1-201ENST00000491506 1078 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GLI3P10071 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GLI3P10071 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GLI3P10071 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GLI3P10071 ADH1B-207ENST00000639454 1210 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GLI3P10071 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GLI3P10071 TTN-AS1-264ENST00000627564 1319 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GLI3P10071 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GLI3P10071 SERHL2-201ENST00000327678 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GLI3P10071 INCA1-201ENST00000355025 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GLI3P10071 MPZL3-204ENST00000527472 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GLI3P10071 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GLI3P10071 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GLI3P10071 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GLI3P10071 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GLI3P10071 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GLI3P10071 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GLI3P10071 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GLI3P10071 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GLI3P10071 CA2-201ENST00000285379 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GLI3P10071 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GLI3P10071 HYKK-201ENST00000388988 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GLI3P10071 AC004910.1-201ENST00000433493 787 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GLI3P10071 AL359182.1-201ENST00000435915 469 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GLI3P10071 AC117834.1-201ENST00000523197 602 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GLI3P10071 HNRNPC-221ENST00000555883 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GLI3P10071 CADM1-221ENST00000612235 1042 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GLI3P10071 AC134878.2-201ENST00000620700 1265 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GLI3P10071 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GLI3P10071 IP6K2-211ENST00000432678 1309 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GLI3P10071 FAM83A-AS1-202ENST00000520576 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GLI3P10071 NAAA-203ENST00000505594 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GLI3P10071 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GLI3P10071 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GLI3P10071 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GLI3P10071 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GLI3P10071 MAGEC3-205ENST00000544766 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GLI3P10071 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GLI3P10071 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GLI3P10071 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GLI3P10071 PCP2-201ENST00000311069 776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GLI3P10071 MRPL55-219ENST00000391867 685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GLI3P10071 MACROD2-204ENST00000407045 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GLI3P10071 TISP43-202ENST00000409982 1039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GLI3P10071 LINC00388-201ENST00000412714 663 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GLI3P10071 HNF1A-AS1-201ENST00000433033 612 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GLI3P10071 HNRNPA3P12-201ENST00000437410 1063 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms