Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IFNB1P01574 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFNB1P01574 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IFNB1P01574 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IFNB1P01574 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFNB1P01574 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IFNB1P01574 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IFNB1P01574 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFNB1P01574 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IFNB1P01574 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFNB1P01574 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IFNB1P01574 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFNB1P01574 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IFNB1P01574 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IFNB1P01574 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFNB1P01574 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IFNB1P01574 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFNB1P01574 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFNB1P01574 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IFNB1P01574 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFNB1P01574 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFNB1P01574 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFNB1P01574 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFNB1P01574 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IFNB1P01574 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFNB1P01574 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IFNB1P01574 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFNB1P01574 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IFNB1P01574 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFNB1P01574 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
IFNB1P01574 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IFNB1P01574 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFNB1P01574 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
IFNB1P01574 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFNB1P01574 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFNB1P01574 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IFNB1P01574 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IFNB1P01574 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFNB1P01574 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFNB1P01574 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IFNB1P01574 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IFNB1P01574 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFNB1P01574 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFNB1P01574 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFNB1P01574 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFNB1P01574 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IFNB1P01574 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFNB1P01574 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
IFNB1P01574 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFNB1P01574 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFNB1P01574 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFNB1P01574 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFNB1P01574 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IFNB1P01574 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IFNB1P01574 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFNB1P01574 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFNB1P01574 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFNB1P01574 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IFNB1P01574 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFNB1P01574 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFNB1P01574 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFNB1P01574 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IFNB1P01574 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFNB1P01574 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFNB1P01574 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IFNB1P01574 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFNB1P01574 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFNB1P01574 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IFNB1P01574 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFNB1P01574 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFNB1P01574 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IFNB1P01574 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFNB1P01574 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFNB1P01574 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFNB1P01574 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFNB1P01574 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFNB1P01574 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IFNB1P01574 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
IFNB1P01574 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IFNB1P01574 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IFNB1P01574 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IFNB1P01574 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
IFNB1P01574 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
IFNB1P01574 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IFNB1P01574 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IFNB1P01574 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IFNB1P01574 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IFNB1P01574 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFNB1P01574 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IFNB1P01574 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IFNB1P01574 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IFNB1P01574 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFNB1P01574 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFNB1P01574 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
IFNB1P01574 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IFNB1P01574 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IFNB1P01574 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFNB1P01574 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFNB1P01574 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFNB1P01574 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms