Protein–RNA interactions for Protein: O95049

TJP3, Tight junction protein ZO-3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TJP3O95049 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TJP3O95049 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TJP3O95049 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TJP3O95049 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TJP3O95049 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TJP3O95049 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TJP3O95049 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TJP3O95049 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TJP3O95049 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TJP3O95049 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TJP3O95049 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TJP3O95049 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TJP3O95049 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TJP3O95049 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TJP3O95049 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TJP3O95049 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TJP3O95049 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TJP3O95049 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TJP3O95049 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TJP3O95049 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TJP3O95049 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TJP3O95049 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TJP3O95049 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TJP3O95049 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TJP3O95049 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TJP3O95049 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TJP3O95049 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TJP3O95049 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TJP3O95049 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TJP3O95049 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TJP3O95049 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TJP3O95049 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TJP3O95049 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TJP3O95049 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TJP3O95049 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TJP3O95049 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TJP3O95049 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TJP3O95049 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TJP3O95049 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TJP3O95049 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TJP3O95049 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TJP3O95049 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TJP3O95049 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TJP3O95049 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TJP3O95049 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TJP3O95049 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TJP3O95049 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TJP3O95049 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TJP3O95049 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TJP3O95049 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TJP3O95049 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TJP3O95049 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TJP3O95049 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TJP3O95049 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TJP3O95049 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TJP3O95049 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TJP3O95049 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TJP3O95049 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TJP3O95049 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TJP3O95049 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TJP3O95049 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TJP3O95049 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TJP3O95049 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TJP3O95049 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TJP3O95049 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TJP3O95049 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TJP3O95049 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TJP3O95049 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TJP3O95049 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TJP3O95049 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TJP3O95049 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TJP3O95049 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TJP3O95049 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TJP3O95049 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TJP3O95049 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TJP3O95049 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TJP3O95049 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TJP3O95049 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TJP3O95049 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TJP3O95049 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TJP3O95049 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TJP3O95049 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TJP3O95049 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TJP3O95049 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TJP3O95049 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TJP3O95049 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TJP3O95049 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TJP3O95049 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TJP3O95049 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TJP3O95049 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TJP3O95049 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TJP3O95049 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TJP3O95049 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TJP3O95049 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TJP3O95049 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TJP3O95049 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TJP3O95049 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TJP3O95049 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TJP3O95049 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TJP3O95049 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms