Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 MAMDC4-201ENST00000317446 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 CNKSR3-204ENST00000479339 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 HERC6-202ENST00000273960 3473 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 VWA5B2-201ENST00000273794 3486 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 EPS15L1-202ENST00000455140 3266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 SYNJ2-208ENST00000640338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 C3orf38-201ENST00000318887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 BTNL8-201ENST00000231229 2229 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 C9orf106-201ENST00000316786 3145 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms