Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms