Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HDAC6Q9UBN7 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms