Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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