Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms