Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM47Q96LD4 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms