Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 ECSIT-211ENST00000592312 1286 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 OSCP1-201ENST00000235532 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 OSCP1-203ENST00000356637 1463 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 AC026786.1-201ENST00000540096 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 RBP4-203ENST00000371469 814 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 AC015691.1-201ENST00000394793 535 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 FAM86JP-202ENST00000484500 988 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 AC004584.1-201ENST00000572187 549 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 MRPS31P4-202ENST00000613769 583 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 AC011477.7-201ENST00000617163 1440 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 NCS1-203ENST00000630865 1092 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 NR1I2-206ENST00000638727 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 ASS1P1-201ENST00000402854 1237 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 CDKN2A-AS1-201ENST00000441769 823 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 AC092295.1-201ENST00000446262 434 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 RPL29P2-202ENST00000498671 657 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 NDUFB2P1-201ENST00000506966 295 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 CETN3-205ENST00000522842 664 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 AL512356.1-201ENST00000548203 535 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 IDH3A-213ENST00000559205 566 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 AL035427.1-201ENST00000602441 387 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 AC139100.2-201ENST00000616901 662 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 AL499606.1-201ENST00000627866 413 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 INCA1-201ENST00000355025 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 TP63-206ENST00000392463 1386 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 EDEM2-201ENST00000374491 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 UCN3-201ENST00000380433 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 KCNMA1-AS1-201ENST00000426234 863 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 HMGA1P2-201ENST00000430198 324 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 GTF2I-203ENST00000443166 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 DLX6-203ENST00000555308 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 SFTPA2-205ENST00000640627 195 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 CCL17-201ENST00000219244 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 MKNK1-205ENST00000428112 1270 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 UGT1A12P-201ENST00000447084 853 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TOPBP1Q92547 AC098820.2-201ENST00000457694 666 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms