Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBJ5

COLGALT1, Procollagen galactosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLGALT1Q8NBJ5 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
COLGALT1Q8NBJ5 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COLGALT1Q8NBJ5 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms