Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85 ms