Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATL3Q6DD88 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms