Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 AL590644.1-201ENST00000412427 4676 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 DYNC1LI1-201ENST00000273130 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 HERC3-203ENST00000407637 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 TCAF2-205ENST00000444908 2976 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 BDH1-201ENST00000358186 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 CREBL2-201ENST00000228865 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 SFTPA1-202ENST00000419470 2210 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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KHDC3LQ587J8 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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KHDC3LQ587J8 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 LINC01019-201ENST00000505443 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 AC145098.2-201ENST00000623593 3026 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
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