Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KLHL22Q53GT1 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KLHL22Q53GT1 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KLHL22Q53GT1 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KLHL22Q53GT1 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KLHL22Q53GT1 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KLHL22Q53GT1 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KLHL22Q53GT1 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KLHL22Q53GT1 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KLHL22Q53GT1 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KLHL22Q53GT1 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KLHL22Q53GT1 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KLHL22Q53GT1 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
KLHL22Q53GT1 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KLHL22Q53GT1 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
KLHL22Q53GT1 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KLHL22Q53GT1 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KLHL22Q53GT1 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KLHL22Q53GT1 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KLHL22Q53GT1 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KLHL22Q53GT1 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
KLHL22Q53GT1 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KLHL22Q53GT1 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
KLHL22Q53GT1 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KLHL22Q53GT1 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KLHL22Q53GT1 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
KLHL22Q53GT1 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KLHL22Q53GT1 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KLHL22Q53GT1 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KLHL22Q53GT1 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KLHL22Q53GT1 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KLHL22Q53GT1 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KLHL22Q53GT1 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KLHL22Q53GT1 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KLHL22Q53GT1 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KLHL22Q53GT1 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KLHL22Q53GT1 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KLHL22Q53GT1 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KLHL22Q53GT1 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KLHL22Q53GT1 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KLHL22Q53GT1 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KLHL22Q53GT1 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KLHL22Q53GT1 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KLHL22Q53GT1 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
KLHL22Q53GT1 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
KLHL22Q53GT1 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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