Protein–RNA interactions for Protein: Q52LG2

KRTAP13-2, Keratin-associated protein 13-2, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-2Q52LG2 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
KRTAP13-2Q52LG2 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms