Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RFTN2Q52LD8 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms