Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DDR2Q16832 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DDR2Q16832 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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