Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FXNQ16595 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FXNQ16595 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FXNQ16595 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FXNQ16595 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FXNQ16595 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FXNQ16595 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FXNQ16595 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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FXNQ16595 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FXNQ16595 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FXNQ16595 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FXNQ16595 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FXNQ16595 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FXNQ16595 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FXNQ16595 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FXNQ16595 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FXNQ16595 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FXNQ16595 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FXNQ16595 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FXNQ16595 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FXNQ16595 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FXNQ16595 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FXNQ16595 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FXNQ16595 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FXNQ16595 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FXNQ16595 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FXNQ16595 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FXNQ16595 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FXNQ16595 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FXNQ16595 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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FXNQ16595 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FXNQ16595 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FXNQ16595 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FXNQ16595 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FXNQ16595 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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FXNQ16595 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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FXNQ16595 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FXNQ16595 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FXNQ16595 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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FXNQ16595 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FXNQ16595 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FXNQ16595 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FXNQ16595 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FXNQ16595 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FXNQ16595 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FXNQ16595 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FXNQ16595 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FXNQ16595 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FXNQ16595 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FXNQ16595 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
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