Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 PDZRN3-AS1-203ENST00000608743 780 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 AC010335.3-201ENST00000623767 531 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 TMEM186-201ENST00000333050 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 MIR766-201ENST00000390223 111 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 AC069257.3-201ENST00000431391 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 AL157823.2-201ENST00000452048 669 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 IGHVII-74-1-201ENST00000517572 241 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 AC114939.1-201ENST00000520980 514 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 AC112694.1-202ENST00000540985 943 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 AC092720.1-202ENST00000565824 555 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 MIR5091-201ENST00000578707 93 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 TTN-AS1-264ENST00000627564 1319 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 ARR3-201ENST00000307959 1292 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 CD8B-202ENST00000349455 849 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 SOD1-202ENST00000389995 865 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 SLC2A11-208ENST00000405847 730 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 RIBC1-203ENST00000414955 1281 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 CHCHD2P6-201ENST00000454346 447 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 AC113398.1-201ENST00000464124 406 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 LINC02507-201ENST00000509370 1028 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 BCAR1P1-201ENST00000553953 636 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 CLDN6-203ENST00000572154 461 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 LINC01836-201ENST00000586061 829 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 ECSIT-211ENST00000592312 1286 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 SDHD-214ENST00000614349 516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 BX510359.7-201ENST00000619819 630 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 ADORA3-204ENST00000632535 1201 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 AC245369.8-201ENST00000636589 306 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 ZC3H8-201ENST00000272570 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 PDHB-210ENST00000485460 1397 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
R3HDM1Q15032 AL031590.1-202ENST00000641466 1737 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
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