Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC11.1□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.1□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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FHL3Q13643 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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FHL3Q13643 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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FHL3Q13643 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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