Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
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