Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ATRQ13535 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ATRQ13535 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ATRQ13535 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ATRQ13535 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ATRQ13535 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ATRQ13535 OR2T27-201ENST00000344889 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ATRQ13535 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ATRQ13535 RIC3-205ENST00000425599 867 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ATRQ13535 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ATRQ13535 AC007391.1-201ENST00000433893 504 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ATRQ13535 MARK2P17-201ENST00000498560 841 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ATRQ13535 SPRY4-AS1-206ENST00000515288 539 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ATRQ13535 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ATRQ13535 ETV4-208ENST00000586826 917 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ATRQ13535 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ATRQ13535 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ATRQ13535 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ATRQ13535 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ATRQ13535 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ATRQ13535 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ATRQ13535 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ATRQ13535 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ATRQ13535 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ATRQ13535 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ATRQ13535 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ATRQ13535 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ATRQ13535 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ATRQ13535 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ATRQ13535 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ATRQ13535 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ATRQ13535 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ATRQ13535 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ATRQ13535 CELA3A-202ENST00000374663 649 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ATRQ13535 TPT1P9-201ENST00000413759 514 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ATRQ13535 CA5BP1-205ENST00000435806 1064 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ATRQ13535 AP002856.3-201ENST00000441665 635 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ATRQ13535 TOB1-AS1-202ENST00000514358 690 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ATRQ13535 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ATRQ13535 CYB5D2-202ENST00000573984 495 ntTSL 4 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ATRQ13535 AC003688.2-201ENST00000576271 415 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ATRQ13535 MIR5193-201ENST00000584510 109 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ATRQ13535 AL031768.1-201ENST00000606542 701 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ATRQ13535 AC083798.2-202ENST00000609469 553 ntTSL 4 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ATRQ13535 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ATRQ13535 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ATRQ13535 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ATRQ13535 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ATRQ13535 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ATRQ13535 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ATRQ13535 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ATRQ13535 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ATRQ13535 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ATRQ13535 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ATRQ13535 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ATRQ13535 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ATRQ13535 HNRNPA1P10-201ENST00000444945 962 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
ATRQ13535 UGT1A12P-201ENST00000447084 853 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
ATRQ13535 AL353653.1-201ENST00000452336 638 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ATRQ13535 KRT127P-201ENST00000547183 433 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
ATRQ13535 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ATRQ13535 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
ATRQ13535 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ATRQ13535 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ATRQ13535 COMMD10-201ENST00000274458 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ATRQ13535 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ATRQ13535 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ATRQ13535 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ATRQ13535 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ATRQ13535 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ATRQ13535 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ATRQ13535 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ATRQ13535 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ATRQ13535 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ATRQ13535 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ATRQ13535 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ATRQ13535 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ATRQ13535 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ATRQ13535 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ATRQ13535 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ATRQ13535 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ATRQ13535 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ATRQ13535 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ATRQ13535 RAI1-AS1-201ENST00000443696 724 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ATRQ13535 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ATRQ13535 RPSAP70-201ENST00000504462 864 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
ATRQ13535 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ATRQ13535 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
ATRQ13535 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ATRQ13535 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
ATRQ13535 BX322562.1-201ENST00000617004 561 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
ATRQ13535 AC010335.3-201ENST00000623767 531 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
ATRQ13535 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ATRQ13535 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ATRQ13535 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ATRQ13535 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ATRQ13535 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ATRQ13535 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ATRQ13535 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
ATRQ13535 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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