Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 NCR1-204ENST00000357397 594 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 MAGEA7P-201ENST00000436482 942 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 SPAG5-AS1-204ENST00000556050 871 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 ZFP1-207ENST00000567481 493 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 AL357143.1-203ENST00000639750 881 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 CMPK1-204ENST00000450808 950 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 CTBP2P6-201ENST00000526402 1229 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 RN7SL524P-201ENST00000581152 300 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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