Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms