Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 SLFNL1-AS1-201ENST00000626479 4800 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 NUMA1-233ENST00000616538 6998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.02■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.02■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.02■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.02■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.02■□□□□ -0
IFFO1Q0D2I5 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 TTC39A-202ENST00000262676 6287 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms