Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREMQ03060 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREMQ03060 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREMQ03060 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREMQ03060 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREMQ03060 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREMQ03060 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREMQ03060 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREMQ03060 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREMQ03060 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREMQ03060 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREMQ03060 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREMQ03060 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREMQ03060 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREMQ03060 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREMQ03060 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREMQ03060 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREMQ03060 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREMQ03060 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREMQ03060 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREMQ03060 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREMQ03060 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREMQ03060 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREMQ03060 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREMQ03060 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREMQ03060 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREMQ03060 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREMQ03060 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREMQ03060 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREMQ03060 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CREMQ03060 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREMQ03060 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREMQ03060 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREMQ03060 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREMQ03060 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREMQ03060 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREMQ03060 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREMQ03060 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREMQ03060 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CREMQ03060 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CREMQ03060 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CREMQ03060 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREMQ03060 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREMQ03060 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREMQ03060 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREMQ03060 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREMQ03060 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREMQ03060 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREMQ03060 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREMQ03060 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREMQ03060 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREMQ03060 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREMQ03060 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREMQ03060 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CREMQ03060 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREMQ03060 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREMQ03060 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREMQ03060 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREMQ03060 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CREMQ03060 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREMQ03060 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREMQ03060 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREMQ03060 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREMQ03060 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREMQ03060 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREMQ03060 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREMQ03060 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREMQ03060 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREMQ03060 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREMQ03060 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CREMQ03060 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREMQ03060 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CREMQ03060 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREMQ03060 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREMQ03060 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREMQ03060 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREMQ03060 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREMQ03060 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREMQ03060 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREMQ03060 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREMQ03060 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREMQ03060 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CREMQ03060 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CREMQ03060 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CREMQ03060 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREMQ03060 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREMQ03060 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREMQ03060 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREMQ03060 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREMQ03060 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREMQ03060 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREMQ03060 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREMQ03060 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREMQ03060 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREMQ03060 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREMQ03060 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREMQ03060 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREMQ03060 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREMQ03060 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CREMQ03060 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms