Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 PIM1-201ENST00000373509 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 KCNIP3-201ENST00000295225 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 IGHG1-202ENST00000390548 2619 ntAPPRIS P5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 CDHR5-202ENST00000358353 3635 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 CACNB4-210ENST00000539935 8378 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 C9orf106-201ENST00000316786 3145 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 SH2D7-201ENST00000328828 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 AC007614.4-201ENST00000564048 1827 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 KRTAP10-4-201ENST00000400374 1643 ntAPPRIS P2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 ILF3-201ENST00000250241 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms