Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPIBQ01892 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPIBQ01892 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPIBQ01892 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPIBQ01892 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPIBQ01892 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPIBQ01892 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPIBQ01892 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPIBQ01892 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPIBQ01892 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPIBQ01892 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SPIBQ01892 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SPIBQ01892 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SPIBQ01892 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SPIBQ01892 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPIBQ01892 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPIBQ01892 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPIBQ01892 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPIBQ01892 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPIBQ01892 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms