Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
OTUD4Q01804 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTUD4Q01804 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
OTUD4Q01804 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTUD4Q01804 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTUD4Q01804 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTUD4Q01804 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
OTUD4Q01804 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTUD4Q01804 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
OTUD4Q01804 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTUD4Q01804 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTUD4Q01804 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTUD4Q01804 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTUD4Q01804 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
OTUD4Q01804 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
OTUD4Q01804 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
OTUD4Q01804 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
OTUD4Q01804 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
OTUD4Q01804 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
OTUD4Q01804 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
OTUD4Q01804 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
OTUD4Q01804 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
OTUD4Q01804 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
OTUD4Q01804 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
OTUD4Q01804 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
OTUD4Q01804 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
OTUD4Q01804 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
OTUD4Q01804 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
OTUD4Q01804 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
OTUD4Q01804 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
OTUD4Q01804 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.02■□□□□ -0
OTUD4Q01804 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
OTUD4Q01804 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
OTUD4Q01804 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.02■□□□□ -0
OTUD4Q01804 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.02■□□□□ -0
OTUD4Q01804 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
OTUD4Q01804 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.02■□□□□ -0
OTUD4Q01804 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
OTUD4Q01804 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
OTUD4Q01804 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
OTUD4Q01804 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
OTUD4Q01804 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
OTUD4Q01804 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
OTUD4Q01804 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
OTUD4Q01804 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
OTUD4Q01804 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
OTUD4Q01804 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
OTUD4Q01804 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
OTUD4Q01804 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
OTUD4Q01804 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
OTUD4Q01804 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
OTUD4Q01804 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
OTUD4Q01804 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
OTUD4Q01804 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
OTUD4Q01804 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
OTUD4Q01804 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
OTUD4Q01804 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
OTUD4Q01804 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
OTUD4Q01804 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
OTUD4Q01804 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
OTUD4Q01804 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
OTUD4Q01804 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
OTUD4Q01804 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
OTUD4Q01804 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
OTUD4Q01804 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
OTUD4Q01804 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
OTUD4Q01804 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
OTUD4Q01804 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
OTUD4Q01804 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
OTUD4Q01804 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
OTUD4Q01804 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
OTUD4Q01804 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
OTUD4Q01804 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
OTUD4Q01804 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
OTUD4Q01804 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
OTUD4Q01804 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
OTUD4Q01804 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
OTUD4Q01804 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
OTUD4Q01804 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
OTUD4Q01804 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
OTUD4Q01804 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
OTUD4Q01804 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
OTUD4Q01804 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
OTUD4Q01804 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
OTUD4Q01804 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
OTUD4Q01804 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
OTUD4Q01804 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
OTUD4Q01804 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
OTUD4Q01804 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
OTUD4Q01804 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
OTUD4Q01804 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
OTUD4Q01804 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
OTUD4Q01804 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
OTUD4Q01804 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
OTUD4Q01804 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
OTUD4Q01804 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
OTUD4Q01804 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
OTUD4Q01804 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
OTUD4Q01804 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
OTUD4Q01804 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms