Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms