Protein–RNA interactions for Protein: P55899

FCGRT, IgG receptor FcRn large subunit p51, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCGRTP55899 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FCGRTP55899 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FCGRTP55899 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FCGRTP55899 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FCGRTP55899 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FCGRTP55899 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FCGRTP55899 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FCGRTP55899 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FCGRTP55899 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FCGRTP55899 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FCGRTP55899 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
FCGRTP55899 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
FCGRTP55899 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FCGRTP55899 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms