Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RAD23AP54725 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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